Meu pequeno Johnny é a história de um garoto de 12 anos que sofre psicologicamente com seus pais, pois eles são pessoas emocionalmente muito complicadas. Todas as vezes que ele passa por uma situação de sofrimento com os pais ao presenciar uma briga, por exemplo, magicamente, um facho de luz passa pelo local onde está acontecendo o sofrimento. O poder desta luz deixa Johnny mais inteligente, mais consciente de suas emoções e também das emoções dos seus pais. Apenas ele a enxerga. Certo dia, a luz o transporta para um mundo fantástico onde ele encontra um hospital para crianças numa floresta. Neste hospital, as feridas emocionais das crianças se transformam em feridas físicas, tornando possível para os médicos tratá-las. As crianças lá estão todas machucadas, mas podem se recuperar. Inclusive Johnny. Com a ajuda do irreverente Dr. Jekytipapo, de um adolescente esperto chamado Peter, de um mago chamado Ud-Din e de uma menina do hospital chamada Tatyana, Johnny viverá algumas aventuras em busca da cura para seus processos emocionais. Seu último objetivo é chegar ao Vale dos Sentimentos, lugar onde ele poderá se encontrar e se curar, ou se perder para sempre.